Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Gm3542K7N6U2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gm3542K7N6U2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
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