Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm20877J3QPZ4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Gm20877J3QPZ4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm20877J3QPZ4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm20877J3QPZ4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm20877J3QPZ4 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm20877J3QPZ4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm20877J3QPZ4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm20877J3QPZ4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20877J3QPZ4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm20877J3QPZ4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm20877J3QPZ4 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20877J3QPZ4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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Gm20877J3QPZ4 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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