Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX0

5730507C01Rik, RIKEN cDNA 5730507C01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5730507C01RikJ3QPX0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
5730507C01RikJ3QPX0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
5730507C01RikJ3QPX0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms