Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm5225J3QPL3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm5225J3QPL3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms