Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Gm21972J3QN38 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gm21972J3QN38 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms