Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gm21060J3KMU4 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm21060J3KMU4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms