Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS0

Gm21411, Predicted gene, 21411, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21411J3KMS0 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21411J3KMS0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21411J3KMS0 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21411J3KMS0 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21411J3KMS0 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21411J3KMS0 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21411J3KMS0 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm21411J3KMS0 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Gm21411J3KMS0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms