Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm29394H3BIW7 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm29394H3BIW7 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms