Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Pabpc4lG5E8X2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pabpc4lG5E8X2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms