Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Arfip1G5E8V9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Arfip1G5E8V9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms