Protein–RNA interactions for Protein: G5E8P0

Tubgcp6, Gamma-tubulin complex component 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp6G5E8P0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubgcp6G5E8P0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tubgcp6G5E8P0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubgcp6G5E8P0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms