Protein–RNA interactions for Protein: G5E897

Kdelc2, KDEL (Lys-Asp-Glu-Leu) containing 2, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdelc2G5E897 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kdelc2G5E897 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kdelc2G5E897 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms