Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Rnf148G3X9R7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rnf148G3X9R7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms