Protein–RNA interactions for Protein: F8VPY8

Colca2, COLCA2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colca2F8VPY8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Colca2F8VPY8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Colca2F8VPY8 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms