Protein–RNA interactions for Protein: F8VPQ2

Arid4a, AT-rich interactive domain 4A (RBP1-like), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid4aF8VPQ2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arid4aF8VPQ2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arid4aF8VPQ2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms