Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-M1F7CXU4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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H2-M1F7CXU4 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
H2-M1F7CXU4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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