Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
3110082J24RikF6Z6Z2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
3110082J24RikF6Z6Z2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
3110082J24RikF6Z6Z2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
3110082J24RikF6Z6Z2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
3110082J24RikF6Z6Z2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
3110082J24RikF6Z6Z2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
3110082J24RikF6Z6Z2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
3110082J24RikF6Z6Z2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms