Protein–RNA interactions for Protein: F6YKI2

Gm8220, Predicted gene 8220 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8220F6YKI2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm8220F6YKI2 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm8220F6YKI2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms