Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rnf212F6TQD1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rnf212F6TQD1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms