Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lmod3E9QA62 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lmod3E9QA62 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms