Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TrdnE9Q9K5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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TrdnE9Q9K5 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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TrdnE9Q9K5 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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TrdnE9Q9K5 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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TrdnE9Q9K5 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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TrdnE9Q9K5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TrdnE9Q9K5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms