Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8Q6

Ccdc141, Coiled-coil domain-containing 141, mousemouse

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc141E9Q8Q6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Ccdc141E9Q8Q6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ccdc141E9Q8Q6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms