Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdhr2E9Q7P9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdhr2E9Q7P9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdhr2E9Q7P9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms