Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Col22a1E9Q7P1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Col22a1E9Q7P1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Col22a1E9Q7P1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms