Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Urb2E9Q7L1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Urb2E9Q7L1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC30.76■■■□□ 2.52
Urb2E9Q7L1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Urb2E9Q7L1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms