Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp31E9Q6Y8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp31E9Q6Y8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Usp31E9Q6Y8 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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