Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc85cE9Q6B2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc85cE9Q6B2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc85cE9Q6B2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms