Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ythdc1E9Q5K9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Ythdc1E9Q5K9 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ythdc1E9Q5K9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms