Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L2

Pi4ka, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4kaE9Q3L2 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Pi4kaE9Q3L2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Pi4kaE9Q3L2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pi4kaE9Q3L2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pi4kaE9Q3L2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pi4kaE9Q3L2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pi4kaE9Q3L2 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pi4kaE9Q3L2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pi4kaE9Q3L2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pi4kaE9Q3L2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pi4kaE9Q3L2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pi4kaE9Q3L2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pi4kaE9Q3L2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pi4kaE9Q3L2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Pi4kaE9Q3L2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 533.9 ms