Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nup153E9Q3G8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nup153E9Q3G8 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nup153E9Q3G8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms