Protein–RNA interactions for Protein: E9Q236

Abcc4, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc4E9Q236 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcc4E9Q236 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc4E9Q236 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc4E9Q236 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc4E9Q236 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc4E9Q236 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc4E9Q236 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Abcc4E9Q236 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Abcc4E9Q236 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcc4E9Q236 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms