Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp558E9Q1J0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Zfp558E9Q1J0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Zfp558E9Q1J0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms