Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gm3095E9Q058 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Gm3095E9Q058 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms