Protein–RNA interactions for Protein: E9PYW5

Vmn1r174, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r174E9PYW5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r174E9PYW5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r174E9PYW5 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r174E9PYW5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r174E9PYW5 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r174E9PYW5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r174E9PYW5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r174E9PYW5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r174E9PYW5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r174E9PYW5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r174E9PYW5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r174E9PYW5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r174E9PYW5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vmn1r174E9PYW5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms