Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trim30dE9PWL0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Trim30dE9PWL0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms