Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gm3002E9PW72 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Gm3002E9PW72 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms