Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccdc175E9PVB3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ccdc175E9PVB3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms