Protein–RNA interactions for Protein: E9PV48

Ifit3b, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3B, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit3bE9PV48 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ifit3bE9PV48 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifit3bE9PV48 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifit3bE9PV48 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifit3bE9PV48 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifit3bE9PV48 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifit3bE9PV48 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms