Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Syde2E9PUP1 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Syde2E9PUP1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Syde2E9PUP1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms