Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Klhl3E0CZ16 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Klhl3E0CZ16 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms