Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
BC035044E0CXF8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
BC035044E0CXF8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms