Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1P8

4930467E23Rik, RIKEN cDNA 4930467E23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930467E23RikD3Z1P8 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
4930467E23RikD3Z1P8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
4930467E23RikD3Z1P8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms