Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700015F17RikD3YUK8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
1700015F17RikD3YUK8 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms