Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdzd8B9EJ80 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd8B9EJ80 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms