Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Phf11cB4XVP9 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11cB4XVP9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms