Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pnldc1B2RXZ1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pnldc1B2RXZ1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms