Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cspp1B2RX88 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cspp1B2RX88 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms