Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Usf3B2RUQ2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Usf3B2RUQ2 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms