Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Slc22a28B2RT89 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Slc22a28B2RT89 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms