Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Apol7aB2RT54 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Apol7aB2RT54 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms